Жаль, что я пока не могу предложить бинарный формат аналогичной базы по городам, но воспользуюсь, естественно, возможностью упомянуть о своей базе по странам, которая намного лучше (в смысле, точнее) максминда, даже их платной версии.
Наша база WorldIP основана на данных с корневых маршрутизаторов с многих точек планеты, поэтому в ней реальные расположения сетей. Для нее нужен только geo модуль (в Nginx-e по умолчанию), сама база уже отформатирована под Nginx. http://www.wipmania.com/ru/base/
Как альтернативный вариант, как для сравнения, так и для работы возможно запускать обе базы одновременно, WorldIP через geo модуль и Maxmind через новый geoip модуль.
