Я бы грешил на то, что nginx пытается зачитать не до конца
скопированный файл.
Такая ситуация не редкость, и не только на серверах, но никогда к
проблемам не приводит вроде бы. В любом случае, такой вариант крайне
маловероятен. На сайте информация о файле со ссылкой на закачку
публикуется только после завершения копирования. Да и в логах ничего нет.
