./configure --prefix=/srv/nginx-new --with-http_stub_status_module 
--with-http_addition_module --with-http_ssl_module 
--with-http_sub_module --with-cc-opt="-O3 -m64 -march=x86-64 
-I/srv/lib-zlib/include -I/srv/lib-pcre/include 
-I/srv/openssl/include" --with-ld-opt="-L/srv/lib-zlib/lib 
-L/srv/lib-pcre/lib -L/srv/openssl/lib -ldl"
Когда собирал на второй машине чтоб не перенабирать снова сделал nginx 
-V со следующими результатами
nginx version: nginx/0.6.26
built by gcc 4.1.2 20061115 (prerelease) (Debian 4.1.1-21)
configure arguments: --prefix=/srv/nginx-new 
--with-http_stub_status_module --with-http_addition_module 
--with-http_ssl_module --with-http_sub_module --with-cc-opt=-O3 -m64 
-march=x86-64 -I/srv/lib-zlib/include -I/srv/lib-pcre/include 
-I/srv/openssl/include --with-ld-opt=-L/srv/lib-zlib/lib 
-L/srv/lib-pcre/lib -L/srv/openssl/lib -ldl
IMHO ковычки обрабатывает shell и nginx их даже не видит.